První zmínku o zdejší jednotřídní farní škole máme z roku 1730, kdy bylo její zřízení potvrzeno. Tehdy se učilo v různých pronajatých místnostech, neboť Stěžery neměly vlastní školní budovu. Ta byla postavena až kolem roku 1760. Byla to přízemní a dřevěná chaloupka naproti zámku. To již šlo o filiálku kuklenské farní školy, k níž náležely Stěžery a od Libčan odškolené Hřibsko. Chodily sem však i děti ze zadních Svobodných Dvorů (Chaloupky), které měly docházet přímo do Kuklen, ale sem to měly mnohem blíže.
Kolem roku 1787 vrchnost postavila novou zděnou školu na místě, kde se nachází ta současná a ve staré škole byl byt učitele. V roce 1817 byl k nové škole přistavěn byt učitele. Roku 1849 byly ke Stěžerám oficiálně přiškoleny horní (zadní) Svobodné Dvory s 15 domy, jež do té doby náležely do Kuklen. V roce 1859 byla škola přestavěna, aby měla místo pro nově zřízenou 2. třídu. O 2 roky později byla dosavadní filiální škola povýšena na farní. Roku 1863 došlo k přiškolení Stěžírek a Charbuzic. 25.-28. června 1866 posloužila školní budova k ubytování rakouské vojenské hudby. 3. července téhož roku byla její severní zeď poškozena dělostřeleckou palbou. Aby toho nebylo málo, byla v noci vyrabována pruskými vojáky, kteří zaútočili z blízkých lesů. Druhého dne zde zřídili vojenskou nemocnici a v 1. třídě skladiště potravin. Knihami a dalšími pomůckami si topili. Prusové z obce odtáhli až 2. srpna 1866, kdy se přesunuli do Dobřenic. V roce 1870 byl slavnostně pořízen školní prapor, jenž byl o rok později ozdoben obrazem sv. Aloise od královéhradeckého akademického malíře Adolfa Russa. Roku 1872 bylo ve školní zahradě vysázeno na 30 sazenic moruší, které nakoupil řídící učitel. V roce 1875 byla při obecné škole povolena 3. třída se služným III. třídy. K jejímu otevření však došlo až o rok později, kdy byl ke školní budově přistavěn byt pro řídícího učitele a z jeho dosavadního bytu byla upravena právě 3. třída. Roku 1878 došlo ke zřízení letní tělocvičny a v roce 1886 byla otevřena 4. třída.
O letních prázdninách ve školním roce 1886-1887 získala školní budova přístavbu 1. poschodí. Náklad těchto prací dosáhl 15 000 K. O rok později byla u školy znovuzřízena zahrádka. 19. července 1891 se zastavilo ve Stěžerách kolem 150 Rusínů, kteří mířili na jubilejní výstavu v Praze. Nenechali si ujít ani návštěvu zdejší školy, která se jim v mnohém zalíbila a nejraději by si ji přenesli do své domoviny, kde byly tehdejší poměry v oblasti školství přímo tristní. Roku 1892 vznikla při škole zkušební ovocná školka. 19. listopadu 1902 vypukl v čp. 31 požár. Díky tomu, že vítr vál severním směrem, se škole nic zvláštního nestalo, pouze popraskalo 15 okenních tabulí. Následujícího roku se škola prezentovala na výstavě českého severovýchodu v Hořicích, ale obdobných přehlídek se zúčastnila již dávno předtím. V roce 1907 došlo k odškolení Hřibska, neboť tam byla postavena nová školní budova. 19. března 1912 zemřel řídící učitel Alois Styblík, který působil ve Stěžerách přes 30 let. Roku 1912 byla do školy zavedena elektřina. 21. ledna 1913 byla ve schůzi českého odboru c. k. zemské školní rady povolena přeměna IV. zatímní třídy postupné v definitivní. V roce 1919 byly před školou vysázeny lípy Svobody. Roku 1922 byly zadní Svobodné Dvory odškoleny ke Svobodným Dvorům. 23. dubna 1924 přijeli do Stěžer učitelé ze slovenského Ružomberku, kteří se zúčastnili i samotného vyučování. V roce 1935 byla u lípy Svobody postavena malá skalka označující lípu Svobody, která byla přemístěna od školní budovy na původní místo na školní zahrádce, kde stávala lípa korunního prince Rudolfa.
Do roku 1948 fungovala škola jako obecná. Tehdy byla navíc zřízena MŠ, otevřená 1. září 1948, kterou v roce 1976 navštěvovalo 28 dětí. V letech 1948-1961 šlo o školu národní a od roku 1961 základní devítiletou, resp. základní školu, jež dosud funguje, i když se v minulosti objevil několikrát plán na její uzavření, čemuž bylo zabráněno různými úlitbami, třeba návštěvami několika sovětských delegací. Koncem 70. let 20. století byla v akci Z vybudována nová mateřská škola, jež byla otevřena v roce 1978 (Spojovací čp. 232), kde se nachází rovněž školní jídelna, jež byla zmodernizována roku 2014. V roce 2003 získala škola právní subjektivitu a stala se příspěvkovou organizací (zřizovací listinou z 3. října 2002 s účinností od 1. ledna 2003), přičemž roku 2009 se stala čtyřtřídní a o 2 roky později se sloučila s mateřskou školou, čímž vznikla Základní škola a mateřská škola Stěžery. V roce 2012 získal objekt novou střechu. O rok později byly provedeny úpravy čp. 32 podle projektu Ing. Martina Dohnala. Na podporu školy byl 13. března 2018 ustaven Klub přátel Základní školy a mateřské školy Stěžery. V letech 2018-2019 byla provedena přístavba školy podle projektu Ing. Milana Liskovského a ta navíc získala spolu se starou budovou zateplení s novou fasádou podle projektu Jany Vackové, i když objekt školy prošel vícero změnami a úpravami, na jejichž vyjmenování tu není ani místo. Více o škole se lze dozvědět na webu školy:
https://www.zsmsstezery.cz.